Un commissaire du gouvernement, désigné par le Ministre de l'Intérieur après avis du Ministre chargé de la Recherche, assiste aux séances du Conseil avec voix consultative. Il veille au respect des statuts et du caractère d'Utilité Publique de l'activité de la Fondation. Il s'agit du Préfet de la Région Hauts-de-France, Monsieur Michel Lalande.